Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01679 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01679 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01679 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01679 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01679 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01679 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01679 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01679 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01679 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01679 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01679 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01679 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01679 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01679 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01679 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01679 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01679 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01679 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01679 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01679 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01679 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01679 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01679 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01679 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01679 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01679 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01679 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms