Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01657 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01657 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01657 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01657 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01657 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01657 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01657 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01657 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01657 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01657 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01657 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01657 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01657 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01657 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01657 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01657 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01657 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01657 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01657 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01657 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
P01657 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01657 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01657 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01657 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01657 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01657 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01657 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01657 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01657 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms