Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tom1O88746 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1O88746 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1O88746 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1O88746 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1O88746 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1O88746 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1O88746 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1O88746 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1O88746 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1O88746 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms