Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hcn2O88703 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms