Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnk4O88454 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnk4O88454 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms