Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xirp1O70373 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms