Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtssO70370 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtssO70370 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtssO70370 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtssO70370 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtssO70370 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtssO70370 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CtssO70370 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtssO70370 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CtssO70370 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CtssO70370 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtssO70370 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CtssO70370 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CtssO70370 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtssO70370 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtssO70370 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtssO70370 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtssO70370 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtssO70370 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtssO70370 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtssO70370 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtssO70370 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtssO70370 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtssO70370 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtssO70370 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtssO70370 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtssO70370 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CtssO70370 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtssO70370 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtssO70370 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtssO70370 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtssO70370 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtssO70370 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms