Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Capn1O35350 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn1O35350 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn1O35350 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn1O35350 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn1O35350 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms