Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srsf5O35326 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf5O35326 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms