Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Alx4O35137 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms