Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Polr1aO35134 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr1aO35134 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms