Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GclmO09172 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GclmO09172 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GclmO09172 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GclmO09172 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GclmO09172 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GclmO09172 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GclmO09172 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GclmO09172 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GclmO09172 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GclmO09172 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GclmO09172 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GclmO09172 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GclmO09172 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GclmO09172 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GclmO09172 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GclmO09172 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GclmO09172 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GclmO09172 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GclmO09172 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GclmO09172 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GclmO09172 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GclmO09172 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms