Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha8O09127 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epha8O09127 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms