Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sypl1O09117 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms