Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClockO08785 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClockO08785 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClockO08785 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClockO08785 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClockO08785 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClockO08785 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClockO08785 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClockO08785 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClockO08785 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms