Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Barx2O08686 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Barx2O08686 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Barx2O08686 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Barx2O08686 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms