Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MttpO08601 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MttpO08601 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MttpO08601 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MttpO08601 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MttpO08601 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MttpO08601 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MttpO08601 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MttpO08601 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MttpO08601 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MttpO08601 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MttpO08601 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MttpO08601 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MttpO08601 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MttpO08601 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MttpO08601 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MttpO08601 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MttpO08601 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MttpO08601 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MttpO08601 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MttpO08601 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MttpO08601 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MttpO08601 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MttpO08601 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MttpO08601 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MttpO08601 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MttpO08601 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MttpO08601 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MttpO08601 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MttpO08601 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MttpO08601 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms