Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21310J3QQ23 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm21310J3QQ23 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm21310J3QQ23 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm21310J3QQ23 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm21310J3QQ23 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Gm21310J3QQ23 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Gm21310J3QQ23 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm21310J3QQ23 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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