Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm2035J3QP87 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm2035J3QP87 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2035J3QP87 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm2035J3QP87 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm2035J3QP87 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2035J3QP87 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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