Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Zfp616J3QN14 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Zfp616J3QN14 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Zfp616J3QN14 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp616J3QN14 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp616J3QN14 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp616J3QN14 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp616J3QN14 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Zfp616J3QN14 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp616J3QN14 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp616J3QN14 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp616J3QN14 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp616J3QN14 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Zfp616J3QN14 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp616J3QN14 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Zfp616J3QN14 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Zfp616J3QN14 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Zfp616J3QN14 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Zfp616J3QN14 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp616J3QN14 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Zfp616J3QN14 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms