Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm20834J3QM72 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20834J3QM72 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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