Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem200cJ3QK46 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms