Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms