Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Taf4bG5E8Z2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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