Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pabpc4lG5E8X2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc4lG5E8X2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms