Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn20G5E8X0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn20G5E8X0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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