Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Obox6G3X9U1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Obox6G3X9U1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms