Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf148G3X9R7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf148G3X9R7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf148G3X9R7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf148G3X9R7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf148G3X9R7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf148G3X9R7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf148G3X9R7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf148G3X9R7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf148G3X9R7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf148G3X9R7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf148G3X9R7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf148G3X9R7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf148G3X9R7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms