Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zc3h12bG3X9I7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zc3h12bG3X9I7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms