Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms