Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd5G3UW60 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms