Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ercc6F8VPZ5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6F8VPZ5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms