Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd50F7BE84 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd50F7BE84 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd50F7BE84 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd50F7BE84 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd50F7BE84 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd50F7BE84 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd50F7BE84 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd50F7BE84 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd50F7BE84 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd50F7BE84 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd50F7BE84 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd50F7BE84 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd50F7BE84 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd50F7BE84 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd50F7BE84 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd50F7BE84 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms