Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms