Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
3110082J24RikF6Z6Z2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms