Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8444F6XS56 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms