Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Zfp988F6VKC7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Zfp988F6VKC7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp988F6VKC7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Zfp988F6VKC7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Zfp988F6VKC7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Zfp988F6VKC7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp988F6VKC7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Zfp988F6VKC7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Zfp988F6VKC7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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