Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syngap1F6SEU4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngap1F6SEU4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms