Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm340F6RGI3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm340F6RGI3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms