Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf165E9QAU8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf165E9QAU8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf165E9QAU8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf165E9QAU8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf165E9QAU8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf165E9QAU8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms