Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf4E9QAP7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms