Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col22a1E9Q7P1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col22a1E9Q7P1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms