Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp31E9Q6Y8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp31E9Q6Y8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp31E9Q6Y8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp31E9Q6Y8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp31E9Q6Y8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp31E9Q6Y8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp31E9Q6Y8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms