Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Hectd4E9Q2E4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms