Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp558E9Q1J0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms