Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fndc1E9Q043 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc1E9Q043 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fndc1E9Q043 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms