Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20425E9Q035 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms