Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chd2E9PZM4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chd2E9PZM4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chd2E9PZM4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms