Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rsph10bE9PYQ0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms