Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5415E9PXF3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms